Néon Genesis Evangelion – Iron maiden 2nd prend place à l’intérieur de la première série, et nous permet d’en retrouver les personnages principaux, des adolescents perturbés qui doivent piloter des robots hybrides pour combattre une étrange invasion extraterrestre. On suit leur relations complexes, on comprend leur psychologie plus en détail, le voile se lève sur des questions demeurées en suspend jusqu’ici…