Resumen : Nous sommes en 2999, la 3ème guerre interplanétaire vient de prendre fin. Mais un vaisseau de l'Alliance impériale fait son apparition dans le système solaire. Sa puissance surpasse celle de tous les autres vaisseaux et la défaite des terriens semble inévitable. Il ne reste alors qu'un seul recours : utiliser le "X Bomber", un prototype de vaisseau de combat (bombardier Xanta). Les cadets les plus prometteurs de l'académie Star Fleet sont envoyés à son bord : Cyril, Héraclès et Léo (Shiro, Barry et John en VO).
Vont les accompagner également le Docteur Ben, le robot PPA, et la mystérieuse Floriane (Lamia) qui ne se sépare jamais de son garde du corps nommé Raspoutnick (Kirara). La bataille va alors pouvoir commencer...